Второй том издания включает наиболее известное произведение Бэкона "Новый Органон", в котором он дает критику схоластической логики и развернутое изложение своего индуктивного метода. Том содержит также сочинение "Приготовление к естественной и экспериментальной истории…" (не входившее в первое издание), трактаты "О мудрости древних", "О началах и истоках…", в которых выражено своеобразное отношение Бэкона к античной философской традиции и мифологии, и, наконец, знаменитые "Опыты и наставления…" и утопию "Новая Атлантида".